CeFU har en meget engageret bestyrelse, der er med til at sætte kursen for forskningscenteret og forskningen i ungdom. Den varetager samtidigt den løbende drift af Foreningen Center for Ungdomsforskning og mødes fire gange om året. Bestyrelsen vælges hvert år i marts ved foreningens generalforsamling.
Bestyrelsen består af følgende repræsentanter:
- Forperson: Torben Vind Rasmussen, Efterskoleforeningen
- Næstforperson: Christine Ravn Lund, Dansk Ungdoms Fællesråd
- Anita lindquist Henriksen, Danske HF & VUC
- Anja Østergaard Jensen, Landsforeningen af 10. klasseskoler
- Birgitte Salling, Ungdomscenter Horsens
- Mads Lerche Møller, Danmarks Lærerforening
- Christina Haahr Bach, Københavns Kommune, Børne- og Ungdomsforvaltningen
- Henrik Hald Krogh, Ungdomsringen
- Laura Vilsbæk, DGI
- Ejnar Bo Pedersen, Ungdomsskoleforeningen
- Ene Wolfsberg, FGU Danmark
- Per Bredholt Frederiksen, Børne- og Undervisningsministeriet
- Karin Ingemann, Danmarks Idrætsforbund
- Jesper Østrup, Danske Erhvervsskoler og – Gymnasier
- Jørgen Helbro, Odsherred Kommune
- Kristine Andersen, Københavns Professionshøjskole
- Kristine Wiberg Plougsgaard, KL
- Lars Søgaard Jensen, BUPL
- Lisbeth Trinskjær, Folkehøjskolernes Forening i Danmark (FFD)
- Mai Møller Fogtmann, Gymnasieskolernes Lærerforening (GL)
- Mette de Linde Farrington, HK Danmark
- Katrine Kruse, NEXT Uddannelse København
- Rolf Lange, Fagbevægelsens Hovedorganisation (LO)
- Mette Lyshøj, Dansk Metal
- Allaa Al-Naqach, Friskolerne
- Stine Wilms Høyer, Gentofte Kommune
- Susan Mose, Danske Gymnasier